El Javier centrado en la diversidad de cada uno de sus estudiantes busca potenciar las ocho dimensiones del ser: Ética, Espiritual, Cognitiva, Afectiva, Comunicativa, Estética, Corporal, y Sociopolítica; por lo que continuamente está en una dinámica de innovación en todos sus ámbitos.
El proceso ignaciano de aprendizaje y construcción del conocimiento tiene que ver con el sistema pedagógico que invita al estudiante a contextualizar, experimentar, reflexionar, actuar sobre la realidad y evaluar su forma de proceder; lo que conlleva a prepararse y disponerse uno mismo para superar los obstáculos que impiden la libertad y crecimiento personal en el camino de búsqueda de la verdad; metodología educativa que permite hacer visible los aprendizajes a través de proyectos que generan conocimientos perdurables.
